泛基因組測序

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泛基因組研究,探秘物種間潛在密碼

泛基因組包括核心基因組(Core genome)和非必須基因組(Dispensable genome)。 其中,核心基因組由所有樣本中都存在的序列組成, 一般與物種生物學功能和主要表型特征相關,反映了物種的穩定性; 非必須基因組由僅在單個樣本或部分樣本中存在的序列組成,一般與物種對特定環境的適應性或特有的生物學 特征相關,反映了物種的特性。針對不同但又相互關聯的個體材料進行較高深度測序, 單獨進行組裝,構建泛基因組圖譜,以期獲得該物種完整的遺傳信息。

因材而為,挖掘品種特異性

選擇不同亞種的材料:可以研究物種的起源及演化等重要生物學問題; 選擇野生種和栽培種等不同特性的種質資源:可以發掘重要性狀相關的基因資源,為科學育種提供指導; 選擇不同生態地理類型的種質資源(不同世系):可以開展物種的適應性進化,外來物種入侵性等熱門科學問題的 研究,為分子生態學等學科提供新的研究手段。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析, 每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。


信息分析

泛基因組測序是對多個物種進行低/高深度的測序、組裝和注釋, 通過構建泛基因組圖譜,可得到這個物種的全部基因。同時還可 對多個品種進行比較分析,挖掘品種特有的基因以及變異位點,這 些變異位點以及特有基因往往與物種特有的生物學功能有關。



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