ATAC-seq

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ATAC-seq ? 研究開放染色質的高通量測序技術

ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是一種利用高通量測序對轉座酶易接近核染色質進行分析的方法。通過高活性的 Tn5 轉座酶將測序接頭插入染色質的開放區域,然后通過測序數據來推斷染色質區域的可及性,并計算轉錄因子結合位點和核小體的區域位置。

周期短、范圍廣、特異性強

理論上至少利用500個細胞就可以快速的得到調控的多維信息,比同類產品節省大約3到5個數量級的細胞;通過 Tn5 轉座酶在切割 DNA 時加入接頭序列,經過 PCR 擴增即可獲得測序文庫,該過程數小時內即可完成;可以獲得染色體在某個特定的時空條件下所有開放染色質區域,并不僅僅局限于某個轉錄因子的結合位點,或者某個特定的組蛋白修飾區域。具有“周期短、范圍廣、特異性強”的優勢,已廣泛應用于人、小鼠、豬、雞、牛、扇貝、擬南芥等物種的研究。支持上門服務。


科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。


信息分析

開泰生物 ATAC-seq 項目通過 轉座酶對特定時空開放的核染 色質區域進行切割,獲得該時 空下全基因組中所有活躍轉錄 的調控序列信息,分析轉錄因 子結合信息、核小體區域信 息、轉錄調控元件分布等。



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