FFPE定量蛋白質組學

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簡介

福爾馬林固定的石蠟包埋(formalin-fixedparaffin-embedded,FFPE)組織樣本長期以來被用于組織學和形態學結構的保存,以便對疾病進行組織病理學診斷。這些 FFPE 組織集合連同附加的臨床和結果信息,形成了用于癌癥和其他疾病研究的組織樣本的寶貴資源。

研究意義

基于質譜的蛋白質組學為高通量分析成千上萬的蛋白質提供了可能,因此,將標準蛋白質組學分析技術應用于 FFPE 組織蛋白提取液,將揭示大量與疾病相關的功能信息,從而幫助我們識別與特定疾病診斷、預后、監測和治療相關的有意義的生物標志物。

技術難點

對組織進行甲醛固定及石蠟包埋等處理會導致組織細胞中的蛋白質、核酸等分子發生相當廣泛的分子交聯,使獲取 FFPE 組織內鎖定的蛋白質組變得相當困難。甲醛固定限制了蛋白質的提取效率,損害了免疫反應活性,并可能導致質譜技術對蛋白質的鑒定不明確。因此,需要一種有效的方法從 FFPE 組織中進行蛋白質的提取?;诖?,諾禾致源經過大量文獻調研、研發測試,現已開發出能高質量獲取 FFPE 樣本中蛋白質的提取方法。


參考文獻

Fabian Coscia, Ernst Lengyel, Jaikumar Duraiswamy, et al. Multi-level Proteomics Identifies CT45 as a Chemosensitivity Mediator and Immunotherapy Target in Ovarian Cancer[J]. Cell, 2019, 179: 1-15.


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