ChIP-seq

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解碼蛋白與DNA結合的奧秘

ChIP-seq采用特異性抗體對目的蛋白進行免疫沉淀后, 分離與其結合的基因組DNA片段,并通過高通量測序, 在全基因組范圍內尋找目的蛋白特異結合的DNA位點, 且可基于多個樣品進行差異比較分析及特異蛋白結合位點的序列偏好性分析。

平臺優,周期短,性價比高

用于在全基因組范圍內研究蛋白特異結合的DNA片段, 組蛋白修飾和表觀遺傳修飾的技術,研究這三個主題有助于洞悉蛋白 對基因表達的調控以及染色體的功能結構。 具有“覆蓋全,周期快,分析科學”的優勢, 已廣泛應用于人、小鼠、酵母、水稻、擬南芥等物種的研究。


科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析, 每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。


信息分析

開泰生物ChIP-seq測序項目,通過對IP下來的合格DNA樣本,建庫測 序,獲得高質量reads,根據SCC曲線判斷IP效果,通過motif分析判斷 IP的特異性以及分析的可信性,高效預測相關基因,進行功能富集分析、 預測特異蛋白的功能,組蛋白染色體結合圖譜以及DNA的表觀修飾。



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